FDA頒布的《水產品危害與控制指南》設計并制定了一個完整的HACCP計劃所需要的連續的18個步驟。水產品HACCP法規只要求危害分析，并沒有要求有危害分析的記錄或書面形式，但是FDA希望有一個書面的危害分析，這樣將有助于解釋為什么有些危害包括在HACCP計劃中，有些危害卻不包括在HACCP計劃中。

這18個步驟是：


步驟1：一般資料

在危害分析工作單和HACCP計劃表的相應位置記錄加工者的名稱和地址；


步驟2：描述產品

確定產品中水產品成分的商品名稱或拉丁名稱；完整描述最后產品 ；描述包裝形式；


步驟3：描述銷售和貯存方法

確定產品是如何分銷和分銷后如何貯存；確定是否有特殊的運輸方法。


步驟4：確定預期用途和消費者

確定最終使用者或消費者怎樣使用產品；預期的使用者也包括對產品進行進一步加工的另外的加工者。


步驟5：建立流程圖

流程圖的目的是提供對水產品從原料收購到產品分銷整個加工過程機器有關的配料流程步驟的清晰、簡明的描述


步驟6：建立危害分析工作單

將每一步驟填寫到《危害分析工作單》中的相應位置。


步驟7：確定與品種有關的潛在危害

FDA在《水產品危害與控制指南》中列出了現行的FDA可得到的關于具體的每一品種魚類的危害的最好的資料。即使在日常工作或傳統管理實踐中，危害可能已經被有效地控制，但并不意味著危害是不重要的。


步驟8：確定與加工過程有關的潛在危害

FDA在《水產品危害與控制指南》中列出了現行的FDA可得到的與特定加工技術相關的資料，當然一些危害，如只出現在特定的工廠、設備或加工過程的，仍需要企業依據自己的專業知識或請外面專家來進行判定。

步驟9：填寫危害分析工作單
將潛在危害記錄到危害分析工作單的相關位置。

步驟10：判斷潛在危害
以軟體貝類為例，原料這一環節中包括了怎么樣的潛在危害呢？
　　由于軟體動物生長的周圍環境通常受到含有病原體的公共污水的污染，又受到自然生長細菌的危害，這些細菌將有可能是病原體；軟體動物濾食和濃縮可能存在于周圍海域中的病原體；軟體動物經常被整個食用，生吃或部分蒸煮食用。因此來自捕獲區域的病原體將構成軟體貝類生產的潛在危害。

　　對于這一潛在危害的控制，主要包括了兩個方面的控制：

１　對源自人類／動物病原體的控制。
２ 自然存在的病原體的控制
具體的控制在方法和其他說明，在該指南中有詳細的介紹。
步驟11：確定潛在危害是否顯著
以軟體貝類為例，在每個加工步驟中，確定“來自捕獲海域的病原體”是否是顯著危害：
1 在接收步驟時，來自捕獲海域的病原體的將有可能被帶入嗎？
2 在接收步驟進入的來自捕獲海域的病原體能在本步驟被消除或減少到可接受的水平嗎？
如采取預防措施能用于消除可能來自原料的不安全水平的病原體，或是預防措施能夠把危害出現的可能降低到可接受水平，就應在加工步驟中把“來自捕獲海域的病原體”確定為顯著危害。
步驟12：確定關鍵控制點
以“來自捕獲海域的病原體”這一生物危害為例，若判定某一加工步驟來自捕獲海域的病原體是顯著危害時，應確定是否有必要在該步驟上采取措施以控制危害。通過判斷樹可以判斷是否是關鍵控制點。
在加工期間，產品可以經過有效地蒸煮或殺菌釜處理來殺司病原體嗎？如果可以，則可以確定蒸煮或殺菌釜處理步驟為CCP。如果不可以，那么應確定接收步驟為CCP，通過對軟體貝類來源以及從捕獲到冷藏之間的時間的控制來控制來自捕獲區域的病原體。
步驟13：填寫HACCP計劃表
將找出的危害分析工作單確定為關鍵控制點的加工工序填寫在HACCP計劃表的相關位置。
步驟14：建立關鍵限值（CL）
關鍵限值應設置在一旦偏離就可能會導致不安全產品出現之處。關鍵限值不能過于嚴格，結果會出現實際上沒有發生影響安全的問題就要采取糾偏行動；另一方面，關鍵限值過寬松，會導致不安全的產品流入消費者手中。
以“來自捕獲海域的病原體”的控制為例：
控制策略實例——來源控制
關鍵限值：所有貝類容器必須貼有標簽，顯示捕獲日期、地點，貝類的種類和數量等。
當然，還有其他的控制策略，此處略去不談。
步驟15：建立監控程序
建立一個完整的監控程序，應當回答以下四個問題：
1）監控什么？
2）怎樣監控？
3）監控的頻率？
4）誰來監控？
監控程序特點和監控方法應能確定是否滿足CL。
步驟16：建立糾偏行動程序
以“來自捕獲區域的病原體”為例，在HACCP計劃表中“自捕獲區域的病原體”被判斷為顯著危害的每一加工步驟，都要制定當偏離CL值時應采取的糾偏行動。這些措施包括：確信不安全產品不能到達消費者手中；糾正導致CL偏離的原因。
步驟17：建立記錄保存系統
在HACCP計劃表中，對每一個“來自捕獲區域的病原體”被確定為顯著危害的每一加工步驟，應列出用以證明完成監控程序的記錄。這些記錄要清楚地表明監控程序已經執行，并且要包括監控過程中的實際值和觀察的情況。
步驟18：建立驗證程序
在HACCP計劃表中，對每一個“來自捕獲區域的病原體”被確定為顯著危害的每一加工步驟，應建立驗證程序，以確保HACCP計劃：
1） 足以能控制“來自撲貨區域的病原體”的危害；
2） 能始終如一被執行。